تورج امرایی گفت: درحال‌حاضر آیین‌نامه قبلی ارزیابی شرکت‌های دانش‌بنیان بدون تغییر باقی‌مانده اما درخصوص «نظام ارزیابی» شرکت‌ها در حال بررسی هستیم تا اصلاحاتی در آن اعمال کنیم که پس از نهایی‌شدن این اصلاحات، پیشنهادات به کارگروه دائمی ارائه خواهد شد و در صورت تصویب، به شورای اصلی برای مصوب‌شدن، ارسال می‌شود.
​​​​​​​معاون توسعه شرکت‌های دانش‌بنیان معاونت علمی ریاست‌جمهوری درباره اصلاحات در نظام ارزیابی شرکت‌های دانش‌بنیان توضیح داد و گفت: تغییرات بزرگ و کلیدی نسبت به دوره قبل در دستورکار نیست. در نظر داریم که شبکه متخصصین داخلی کشور را در ارزیابی و تشخیص صلاحیت شرکت‌های دانش‌بنیان گسترده‌تر کنیم و از فعالان باسابقه و برجسته صنعت بهره ببریم تا از تجربیات آنها در بدنه فنی و کارشناسی در فرآیند ارزیابی استفاده کنیم. بنابراین تغییرات پیشنهادی عمدتا گسترده‌تر کردن شبکه متخصصان در تشخیص صلاحیت‌هاست.